婚内抚养费应该支持，理由为：教育、抚养、保护未成年子女是夫妻共同的责任和义务。婚姻关系存续期间，一方独立承担子女的生活费、教育费、医疗费等必须费用，有权向另一方要求补偿。
《民法典》第一千零五十八条：“夫妻双方平等享有对未成年子女抚养、教育和保护的权利，共同承担对未成年子女抚养、教育和保护的义务。”第一千零六十七条：“父母不履行抚养义务的，未成年子女或者不能独立生活的成年子女，有要求父母给付抚养费的权利。”《民法典》婚姻家庭编的解释（一）第四十三条：“婚姻关系存续期间，父母双方或者一方拒不履行抚养子女义务，未成年子女或者不能独立生活的成年子女请求支付抚养费的，人民法院应予支持。”
在分居状态下，夫妻之间共同财产的基础事实上已逐渐消失，如果法院以夫妻共同财产制不支持婚内抚养费，极易产生不公平的结果。现实中因感情不和开始分居甚至引发离婚诉讼的夫妻，很多在分居期间就会开始阻碍个人收入转化为夫妻共同财产，或者转移自己名下的夫妻共同财产，亦可能通过挥霍等方式来避免收入被分割。司法实践中，裁判应坚持未成年子女利益最大化，兼顾公平。
在程序上应允许分居期间抚养费在离婚诉讼中一并处理。离婚诉讼是复合之诉，离婚案件中处理的离婚后子女抚养费问题，事实上也是夫妻一方代替未成年子女在离婚中向对方提出的请求。
分居期间抚养费支付与夫妻共同财产制冲突的解决方案，需要查明夫妻共同财产具体情况区分对待：
一、直接抚养方以掌管的夫妻共同财产支付抚养费的。不支持婚内抚养费请求。
二、一方承担子女抚养费，另一方承担其他家庭生活费用，如保姆的费用、子女的学费、培训费，或是支付夫妻共同房产按揭贷款的。不支持婚内抚养费请求。
三、无夫妻共同财产或直接抚养一方未掌管夫妻共同财产，以分居期间己方收入来支付孩子抚养费的。法院应支持婚内抚养费的请求。